城市轨道交通学院充分发挥专业优势和企业资源优势，积极探索研究生教育“开门办思政”实践育人新模式，统筹推进研究生培养平台、基地、品牌一体化共建。
学院充分发挥“企业学院”优势，统筹学院和企业资源，着重创新学院实践育人模式，加强院企同频联动，拓展研究生培养实践平台。近两年，举办了7场校企共建的“企程讲堂”，引导研究生在专业学习及择业就业中主动服务国家和行业需求。
学院与上海申通地铁集团有限公司、杭州地铁、金华地铁、上海建工集团等20余家大型企业集团和科研院所建立了产学研战略联盟、研究生工作站、三师工作室，深化高层次创新人才培养模式改革，建立“企业-学校”双向导师库，开设出一系列拓展性的专业特色课程，校内导师和企业导师指导研究生开展科研转化主题实践，鼓励师生结合专业课题研究，到基层一线解决具体问题，提高研究生培养质量。
学院依托G60科创走廊区位优势，打造G60思政育人基地，邀请企业导师在学院开展生涯讲堂、微党课、微思政课，向长三角地铁企业发出“企业导师讲思政”的倡议，得到企业的认同和响应，长三角地铁企业思政育人氛围和模式逐渐形成，探索了校企思政育人新模式；坚持校外实践基地的开拓，加强专业实践教育基地建设，深入走访企业，签约产学研基地，积极向外拓宽学生实习基地。
学院立足专业特点，着力典型领航，打磨实践品牌，创建研本一体化特色品牌——青蓓班，针对大一、大二学生开展考研启蒙专题培训班，面向大三、大四学生设立党员考研答疑服务站，对于备考学生结成“一对一”研本帮扶对子，两年来，青蓓班逐步常态化、制度化，研究生“小导师”40人，服务本科生2400人次，学院考研率逐年攀升，助力校院转型发展。
学院注重研究生实践创新能力培养，鼓励并支持研究生参与各项学术项目和学术竞赛。研究生参加“研究生智慧城市技术与创意设计大赛”“全国研究生数学建模竞赛”“研究生智慧城市技术与创意设计大赛”“全国大学生英语竞赛”等竞赛，获奖多达100余项。与此同时，学院研究生取得了众多的科研成果，在国内外期刊上发表学术论文300余篇，申请专利200余项。
学院旨在培养能主动适应上海乃至全国轨道交通发展需要的城市轨道交通专业人才。毕业研究生分赴上海申通地铁集团有限公司、中国铁路上海局集团有限公司、卡斯柯信号有限公司、浙江省地矿勘察院、中铁上海设计院集团有限公司、上海城市交通设计院有限公司等科研院所、事业单位或企业就业，深受用人单位欢迎和认可。